Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18524 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18524 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18524 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18524 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18524 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18524 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P18524 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P18524 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P18524 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms