Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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