Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja1O55176 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms