Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms