Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smad6O35182 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad6O35182 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms