Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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