Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc180J3QNE4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc180J3QNE4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms