Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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Ddx60E9PZQ1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Ddx60E9PZQ1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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Ddx60E9PZQ1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Ddx60E9PZQ1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Ddx60E9PZQ1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Ddx60E9PZQ1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ddx60E9PZQ1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Ddx60E9PZQ1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Ddx60E9PZQ1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx60E9PZQ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms