Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms