Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms