Protein–RNA interactions for Protein: A2ALC6

Gm4985, MCG8129, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm4985A2ALC6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm4985A2ALC6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm4985A2ALC6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm4985A2ALC6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm4985A2ALC6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm4985A2ALC6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm4985A2ALC6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm4985A2ALC6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm4985A2ALC6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms