Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms