Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms