Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms