Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp2Q9Z0E6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms