Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arl6ip1Q9JKW0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms