Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ParvbQ9ES46 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ParvbQ9ES46 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms