Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms