Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9D2Q3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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