Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms