Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ubqln4Q99NB8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ubqln4Q99NB8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ubqln4Q99NB8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ubqln4Q99NB8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Ubqln4Q99NB8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ubqln4Q99NB8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ubqln4Q99NB8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ubqln4Q99NB8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ubqln4Q99NB8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ubqln4Q99NB8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ubqln4Q99NB8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ubqln4Q99NB8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ubqln4Q99NB8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln4Q99NB8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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