Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Smim11aQ99J19 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Smim11aQ99J19 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Smim11aQ99J19 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Smim11aQ99J19 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Smim11aQ99J19 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smim11aQ99J19 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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