Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sntg2Q925E0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms