Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms