Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp38Q8BW70 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp38Q8BW70 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp38Q8BW70 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp38Q8BW70 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp38Q8BW70 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp38Q8BW70 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp38Q8BW70 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp38Q8BW70 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp38Q8BW70 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp38Q8BW70 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp38Q8BW70 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp38Q8BW70 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp38Q8BW70 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Usp38Q8BW70 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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