Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actn1Q7TPR4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms