Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc18Q640L5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc18Q640L5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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