Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmn1r196Q5SVD5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmn1r196Q5SVD5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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