Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms