Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssbp4Q3U4B1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms