Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hvcn1Q3U2S8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Hvcn1Q3U2S8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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Hvcn1Q3U2S8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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Hvcn1Q3U2S8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Hvcn1Q3U2S8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Hvcn1Q3U2S8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Hvcn1Q3U2S8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Hvcn1Q3U2S8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms