Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hace1Q3U0D9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms