Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cul4aQ3TCH7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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