Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Edem3Q2HXL6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Edem3Q2HXL6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms