Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf3ip1Q149C2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms