Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q08AU9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q08AU9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q08AU9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms