Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm3Q08189 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms