Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NrepQ07475 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms