Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gabpb1Q00420 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gabpb1Q00420 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Gabpb1Q00420 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Gabpb1Q00420 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Gabpb1Q00420 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gabpb1Q00420 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabpb1Q00420 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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