Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms