Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1bbP56400 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms