Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PtpreP49446 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PtpreP49446 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PtpreP49446 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PtpreP49446 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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