Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RxrgP28705 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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