Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrbP28704 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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