Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk11bP24788 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms