Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Edn1P22387 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Edn1P22387 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Edn1P22387 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Edn1P22387 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Edn1P22387 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Edn1P22387 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms