Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
UbbP0CG49 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms