Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb6P09023 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb6P09023 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb6P09023 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms