Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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