Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Dsg2O55111 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Dsg2O55111 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Dsg2O55111 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dsg2O55111 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dsg2O55111 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg2O55111 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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